教育背景

2011.09–2015.06，南京农业大学，生物科学，理学学士学位，导师：张群 教授、蒋建东教授

2013.07–2013.08，韩国庆北大学，暑期交换生项目

2014.07–2014.09，美国加州大学戴维斯分校，暑期交换生项目

2015.09–2022.06，南京农业大学，微生物学，理学博士学位（直博），导师：蒋建东 教授

2016.09–2017.10，以色列农业部农业研究中心，生物信息学，访问学者，导师：Shiri Freilich

2018.01–2018.02，美国威斯康星大学麦迪逊分校，访问学者

工作履历

2025.10–至今，华南农业大学资源环境学院，首聘副教授

2022.09–2025.10，华南农业大学，农业资源与环境，博士后，合作导师：仇荣亮 教授

学术兼职

1. 《广东农业科学》编委、《华南农业大学学报》青年编委；

2. 广东省农村专业技术协会人才专家库高层次人才专家 (2024–至今)；

3. Bioresour. Technol.、J. Hazard. Mater.、J. Environ. Chem. Eng.、Appl. Soil Ecol.等期刊审稿人；

4. 创办并运营团队科普公众号 3SR Team，推动科研成果科普化、低碳农业社会化。

研究领域

从事土壤微生物组研究。聚焦开发合成微生物组设计工具，探究代谢互作以优化水土功能并修复污染物，解析土-植互作，构建健康“土-微-植”共生体系。

奖励与荣誉

1. 获2025中国农业科学十大进展（第一完成人）；

2. 获第四届广东省土壤学会青年科技奖（第一完成人）；

3. 获2025年度广东省环境科学学会环境保护科学技术奖一等奖（第十三完成人）；

4. 获九三学社广东省委员会2025年度“启航助力”新社员暨骨干社员培训班演讲比赛二等奖；

5. 获第二十四次全国环境微生物学学术研讨会“简浩然环境微生物学基金”优秀论文奖（第一完成人）。

主持项目

1. 国家自然科学基金面上项目，基于官能团特异性和物质能量耦合的土壤复合污染合成菌群设计与协同修复机制(42677513)，主持，49万元，2027.01.01-2030.12.31，在研；

2. 国家自然科学基金青年基金，根际菌群促进水稻高效利用有机氮的调控机制(42307006)，主持，30万元，2024.01.01-2026.12.31，在研；

3.国家重点研发计划项目，重金属复合污染土壤长效超稳成矿化材料制备技术与应用示范(2023YFC3707605)，子课题负责人，60万元，2024.01.01-2027.12.31，在研；

4.国家重点研发计划项目，种养产业集聚区多源种养废物耦合利用集成技术及示范(2023YFC3905800)，子课题负责人，50万元，2024.01.01-2027.12.31，在研；

5.广东省自然科学基金-面上项目，复合有机污染土壤修复的合成菌群设计及代谢互作机制(2026A1515011402)，主持，10万元，2026.01.01-2028.12.31，在研；

6. 华南农业大学资源环境学院青年人才成长培育项目，大模型驱动炭菌耦合体系构建及有机污染协同代谢机制，主持, 4 万元, 2027.01.01-2027.12.31, 在研；

7.江苏省普通高校学术学位研究生科研创新计划项目，降解敌草胺的两个菌株的代谢模型构建(KYZZ16_0382)，2016-2017年，主持，1.5万元，2016.09-2017.08，已结题；

8.国家大学生创新性实验计划项目，南京小龙山植物内生与土壤微生物群落差异及其矿物风化功能的研究(201310307003)，2013.5-2014.5，主持，1万元，2013.06-2014.05，已结题。

学术成果

已发表论文32篇, 一作/通讯发表19篇：

1.      Ruan Z*, Tan J*, Feng Q, et al. (2026). Potentiators empower synthetic microbiomes as silent guardians against co-contamination. Nature Communications, 17: 1185. (共同一作,中科院1区, IF5-year: 17.2)

2.      Ruan Z*, Chen K*, Cao W, et al. (2024). Engineering natural microbiomes toward enhanced bioremediation by microbiome modeling. Nature Communications, 15(1): 4694. (共同一作,中科院1区, IF5-year: 17.2, 高被引论文 (发表至今被引250次), 被Nature Reviews Bioengineering杂志评为2024年度高亮论文，并入选2025中国农业科学十大进展，Nature Communications杂志2024年度地球、环境与行星科学领域下载次数最高的25篇文章 (Top25)

3.      Jiang G, Yin Y, …, Ruan Z#, et al. (2026). Keystone and Potentiator Taxa in Hyperaccumulator Rhizospheres: A New Perspective for Microbiome-Assisted Phytoremediation. Journal of Hazardous Materials, 515: 143053. (共同通讯, 中科院1区, IF5-year: 11.9)

4.      Jiang G, Ruan Z#, Yin Y, et al. (2025). Keystone species in microbial communities: From discovery to soil heavy metal-remediation. Journal of Hazardous Materials, 494: 138753. (共同通讯, 中科院1区, IF5-year: 11.9)

5.      Huang W, Liu Y, ..., Ruan Z#, et al. (2024). Source-specific soil heavy metal risk assessment in arsenic waste mine site of Yunnan: Integrating environmental and biological factors. Journal of Hazardous Materials, 486: 136902. (共同通讯, 中科院1区, IF5-year: 11.9)

6.      Ruan Z, Xu M, Xing Y, et al. (2022). Interspecies metabolic interactions in a synergistic consortium drive efficient degradation of the herbicide bromoxynil octanoate. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 70(37): 11613-11622. (第一作者, 中科院1区, IF5-year：6.0)

7.      Wu B, Wen Z, Ruan Z#, et al. (2026). Life cycle assessment of regionally functionally-zoned intensive pig farming systems: Carbon footprint analysis and mitigation strategies for sustainable production. Journal of Environmental Management, 412, 130225. (通讯作者, 中科院2区, IF5-year: 9.2)

8.      Ruan Z, Xu M, Xing Y, et al. (2024). Enhanced growth of wheat in contaminated fields via synthetic microbiome as revealed by genome-scale metabolic modeling. Science of The Total Environment, 953:176047. (第一作者, 中科院2区, IF5-year: 8.6)

9.      Zhou D, Yang K, ..., Ruan Z#, et al. (2024). Adaptation of rhizobacterial and endophytic communities in Citrus Grandis Exocarpium to long-term organic and chemical fertilization. Frontiers in Microbiology, 15: 1461821. (通讯作者, 中科院2区, IF5-year: 5.1, 指导本科生为第一作者)

10.   Yang K*, Tan J*, ..., Ruan Z#, et al. (2024). Description and Genomic Characteristics of Diaphorobacter limosus sp. nov., Isolated from a Sewage-Treatment Plant. Current Microbiology, 81: 155. (共同通讯, 中科院3区, IF5-year: 2.4, 指导本科生为第一作者)

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